MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B

Total Repeats: 656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017487	A	6	6	395	400	100 %	0 %	0 %	0 %	385831932
2	NC_017487	AGT	2	6	452	457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831932
3	NC_017487	GAA	2	6	546	551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831932
4	NC_017487	TC	3	6	575	580	0 %	50 %	0 %	50 %	385831932
5	NC_017487	AGA	2	6	584	589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831932
6	NC_017487	T	6	6	600	605	0 %	100 %	0 %	0 %	385831932
7	NC_017487	GCAG	2	8	641	648	25 %	0 %	50 %	25 %	385831932
8	NC_017487	T	6	6	671	676	0 %	100 %	0 %	0 %	385831932
9	NC_017487	A	8	8	688	695	100 %	0 %	0 %	0 %	385831932
10	NC_017487	GTTTGA	2	12	704	715	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385831932
11	NC_017487	ATG	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831932
12	NC_017487	AATC	2	8	803	810	50 %	25 %	0 %	25 %	385831932
13	NC_017487	CA	3	6	824	829	50 %	0 %	0 %	50 %	385831932
14	NC_017487	ATC	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831932
15	NC_017487	GA	3	6	941	946	50 %	0 %	50 %	0 %	385831932
16	NC_017487	TTCAAT	2	12	974	985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385831932
17	NC_017487	A	7	7	1058	1064	100 %	0 %	0 %	0 %	385831932
18	NC_017487	GAA	2	6	1071	1076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831932
19	NC_017487	CTT	2	6	1090	1095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831932
20	NC_017487	GATT	2	8	1133	1140	25 %	50 %	25 %	0 %	385831932
21	NC_017487	A	6	6	1161	1166	100 %	0 %	0 %	0 %	385831932
22	NC_017487	AAG	2	6	1213	1218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831932
23	NC_017487	GCT	2	6	1286	1291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831932
24	NC_017487	CT	3	6	1369	1374	0 %	50 %	0 %	50 %	385831932
25	NC_017487	ACT	2	6	1450	1455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831932
26	NC_017487	A	6	6	1482	1487	100 %	0 %	0 %	0 %	385831932
27	NC_017487	TACC	2	8	1500	1507	25 %	25 %	0 %	50 %	385831932
28	NC_017487	ATG	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831932
29	NC_017487	AAGC	2	8	1586	1593	50 %	0 %	25 %	25 %	385831933
30	NC_017487	A	6	6	1602	1607	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
31	NC_017487	A	7	7	1609	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
32	NC_017487	A	7	7	1648	1654	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
33	NC_017487	ACGTTG	2	12	1668	1679	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385831933
34	NC_017487	TTA	2	6	1692	1697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831933
35	NC_017487	T	7	7	1705	1711	0 %	100 %	0 %	0 %	385831933
36	NC_017487	A	6	6	1727	1732	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
37	NC_017487	CAA	2	6	1736	1741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831933
38	NC_017487	GAC	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831933
39	NC_017487	AAT	2	6	1766	1771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831933
40	NC_017487	TGA	2	6	1777	1782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831933
41	NC_017487	ATTTT	2	10	1805	1814	20 %	80 %	0 %	0 %	385831933
42	NC_017487	A	8	8	1845	1852	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
43	NC_017487	CAA	2	6	1877	1882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831933
44	NC_017487	A	6	6	1901	1906	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
45	NC_017487	AGA	2	6	1912	1917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831933
46	NC_017487	AGG	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831933
47	NC_017487	GAA	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831933
48	NC_017487	AGA	3	9	2044	2052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831933
49	NC_017487	AAAAGA	2	12	2065	2076	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385831933
50	NC_017487	A	6	6	2096	2101	100 %	0 %	0 %	0 %	385831933
51	NC_017487	TGG	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831933
52	NC_017487	GAAA	2	8	2186	2193	75 %	0 %	25 %	0 %	385831934
53	NC_017487	GAA	2	6	2226	2231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
54	NC_017487	AATT	2	8	2267	2274	50 %	50 %	0 %	0 %	385831934
55	NC_017487	T	6	6	2357	2362	0 %	100 %	0 %	0 %	385831934
56	NC_017487	TTA	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831934
57	NC_017487	A	6	6	2427	2432	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
58	NC_017487	AGG	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831934
59	NC_017487	CTT	3	9	2476	2484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831934
60	NC_017487	TCAT	2	8	2566	2573	25 %	50 %	0 %	25 %	385831934
61	NC_017487	A	6	6	2583	2588	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
62	NC_017487	TTA	2	6	2618	2623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831934
63	NC_017487	AGA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
64	NC_017487	T	6	6	2652	2657	0 %	100 %	0 %	0 %	385831934
65	NC_017487	ACT	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831934
66	NC_017487	GAA	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
67	NC_017487	TTTA	2	8	2771	2778	25 %	75 %	0 %	0 %	385831934
68	NC_017487	TTTG	2	8	2813	2820	0 %	75 %	25 %	0 %	385831934
69	NC_017487	TCG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831934
70	NC_017487	A	7	7	2896	2902	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
71	NC_017487	AGG	2	6	2981	2986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831934
72	NC_017487	ATTT	2	8	2987	2994	25 %	75 %	0 %	0 %	385831934
73	NC_017487	ATT	2	6	3044	3049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831934
74	NC_017487	GTT	2	6	3087	3092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831934
75	NC_017487	TTG	2	6	3196	3201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831934
76	NC_017487	CCT	2	6	3233	3238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831934
77	NC_017487	ATC	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831934
78	NC_017487	A	6	6	3245	3250	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
79	NC_017487	TAA	2	6	3251	3256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831934
80	NC_017487	CT	3	6	3285	3290	0 %	50 %	0 %	50 %	385831934
81	NC_017487	CAA	2	6	3309	3314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831934
82	NC_017487	GAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
83	NC_017487	TTG	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831934
84	NC_017487	TGA	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
85	NC_017487	GAA	2	6	3480	3485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
86	NC_017487	ACG	2	6	3519	3524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831934
87	NC_017487	GAT	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
88	NC_017487	AGA	2	6	3626	3631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
89	NC_017487	CAA	2	6	3690	3695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831934
90	NC_017487	ATT	2	6	3701	3706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831934
91	NC_017487	A	6	6	3754	3759	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
92	NC_017487	CACT	2	8	3833	3840	25 %	25 %	0 %	50 %	385831934
93	NC_017487	TGA	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
94	NC_017487	TCA	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831934
95	NC_017487	TGAT	2	8	3937	3944	25 %	50 %	25 %	0 %	385831934
96	NC_017487	A	7	7	3997	4003	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
97	NC_017487	TAG	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
98	NC_017487	TAA	2	6	4100	4105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831934
99	NC_017487	TTG	2	6	4165	4170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831934
100	NC_017487	TA	3	6	4216	4221	50 %	50 %	0 %	0 %	385831934
101	NC_017487	GAAA	2	8	4334	4341	75 %	0 %	25 %	0 %	385831934
102	NC_017487	GAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
103	NC_017487	A	6	6	4422	4427	100 %	0 %	0 %	0 %	385831934
104	NC_017487	GAT	2	6	4502	4507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
105	NC_017487	AGTG	2	8	4514	4521	25 %	25 %	50 %	0 %	385831934
106	NC_017487	AGT	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831934
107	NC_017487	GAG	2	6	4677	4682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831934
108	NC_017487	GAG	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831934
109	NC_017487	TTC	2	6	4727	4732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831934
110	NC_017487	CGT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831934
111	NC_017487	CAA	2	6	4845	4850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831934
112	NC_017487	TAC	2	6	4904	4909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831934
113	NC_017487	GAA	2	6	4986	4991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
114	NC_017487	AATG	2	8	5024	5031	50 %	25 %	25 %	0 %	385831934
115	NC_017487	AGA	2	6	5099	5104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
116	NC_017487	AGA	3	9	5133	5141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
117	NC_017487	AGA	2	6	5153	5158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
118	NC_017487	ACA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831934
119	NC_017487	AGA	2	6	5198	5203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831934
120	NC_017487	CAA	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831935
121	NC_017487	GATG	2	8	5266	5273	25 %	25 %	50 %	0 %	385831935
122	NC_017487	ACT	2	6	5289	5294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831935
123	NC_017487	GAA	2	6	5423	5428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831935
124	NC_017487	GAA	2	6	5582	5587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831935
125	NC_017487	CAA	2	6	5645	5650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831935
126	NC_017487	GCAGGT	2	12	5762	5773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385831935
127	NC_017487	A	6	6	5774	5779	100 %	0 %	0 %	0 %	385831935
128	NC_017487	CAT	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831935
129	NC_017487	TCA	2	6	5922	5927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831935
130	NC_017487	ACG	2	6	5966	5971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831935
131	NC_017487	AGA	2	6	6070	6075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831935
132	NC_017487	CCT	2	6	6107	6112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831935
133	NC_017487	TC	3	6	6145	6150	0 %	50 %	0 %	50 %	385831935
134	NC_017487	T	6	6	6368	6373	0 %	100 %	0 %	0 %	385831935
135	NC_017487	TTA	2	6	6396	6401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831935
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137	NC_017487	TCG	2	6	6421	6426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831935
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